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La versión actual se compone principalmente de alineamiento de secuencias de algoritmos tales como los clásicos métodos de programación dinámica de Needleman & Wunsch (alineamiento global) y Smith & Waterman (adaptación local). También proporciona una interfaz gráfica de usuario simple y herramientas basadas en la línea de comandos para ejecutar la secuencia de algoritmos de alineación de secuencias de ADN y de proteínas.

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